Может быть несколько причин:

1. Неверный ввод кода, например, с пробелом.

2. Долгий ввод кода с Вашей стороны, он действует 30 секунд.

3. В приложении Google Authenticator несколько кодов и вводится неактуальный.

4. Пользователям Android необходимо проверить в настройках Google Authenticator синхронизацию коррекции времени для кодов. Для iOS требуется установить время сети в настройках устройства.